El Departamento de Biología de Organismos y Sistemas participa junto al Departamento de Geología en el Programa de Doctorado en Biogeociencias.
La admisión y seguimiento de los estudiantes de doctorado, la asignación de directores, la aprobación de las actividades formativas, así como de las modificaciones de los proyectos de tesis, corresponden a la Comisión Académica del Programa de Doctorado.
Son miembros de la comisión Aida González Díaz (Coordinadora), Alfredo Fernández Ojanguren, Luis Valledor.